课程论文查重是否由学院统一存档，各个学校操作差异很大，没有统一规定。有的学院把课程论文当成教学档案长期保存，有的查完就删，不保留任何记录。

本科阶段的课程论文通常查重流程比较松散。任课老师用免费或低价查重系统快速检测，重点关注重复率是否超标，报告一般不留档。学生交的是Word文档，老师下载后上传检测平台，看完结果就关闭页面，系统不自动保存。这种临时性检测相当于一次性筛查，论文本身存在老师电脑或教务系统里，但查重报告很少归档。

部分管理严格的学院会要求课程论文进系统存档。比如使用知网课程作业管理系统，学生自己上传检测，报告自动生成并关联学号。这种情况下查重记录会保留在平台数据库，供后续抽查或争议时调取。但这类系统多用于研究生课程或本科毕设前期，普通选修课很少启用。

研究生课程论文的存档要求通常更正式。很多高校把研究生课程论文视同科研成果管理，查重后需提交PDF版本和检测报告至学院教务办，保存期限一般三到五年。如果论文涉及学术不端举报，这些档案就成为关键证据。有些学院还会把优秀课程论文编入内部资料库，这时候查重报告是入库必备材料，必须随论文一并提交。

值得关注的是查重系统的数据留存政策。第三方平台如PaperPass、维普等，用户协议里通常写明检测报告保存一定期限，超期自动清理。但学校自建库或购买的机构版服务，数据存储规则由校方决定。学生端看不到后台设置，无法判断自己的课程论文是否被长期收录进比对库。这意味着你这学期写的课程论文，可能下学期就成为学弟学妹的查重来源，尽管你自己查重时显示合格。

实际操作中，学生能感知到的存档痕迹主要是查重次数限制。有些学校规定课程论文只能免费查重一次，报告生成后下载链接限时有效，过期需重新付费。这种设计倒逼学生保存好报告截图，间接形成了个人存档。但学院层面是否集中保管这些报告，取决于教务管理的精细化程度。

建议学生把课程论文当成正式学术训练对待。即使学院不要求存档，自己也应保留最终版本和检测报告至少到毕业。万一出现成绩争议或学术诚信调查，这些材料是自我辩护的依据。另外，如果课程论文内容后续要扩展成毕业论文，提前保留查重记录可以避免自我重复的尴尬。