脚注是否参与论文查重，其实并没有一个完全统一的标准，不同学校、不同系统的处理方式往往存在差异。大致来说，主要看两个方面，一个是查重系统对脚注的识别能力，另一个是学校采用的检测模式，两方面的因素都考虑进去，问题才会比较清楚。

主流的论文查重系统通常是依靠文档的格式标记来区分正文和脚注的。用 Word 这类工具的插入脚注功能生成的注释，系统一般都能识别出来，部分平台会把这部分剔除掉，不计入重复率，也有平台会单独归类标注，各家处理得并不完全一样。从这个角度看，格式规范的脚注大多不会对整体结果造成太大影响，写作者倒是不必过于担心。

不过值得注意的是，系统识别靠的是格式标记，而不是页面上呈现出来的效果。有些作者习惯在正文中手动输入序号，再在页面底部手写注释内容，这种做法在版面上看着和脚注差不多，但在文档结构里仍然属于普通文本，系统多半会把它按正文处理，其中引用的文献原句也就可能被判定为重复。可见脚注能不能被区别对待，很大程度上取决于生成方式是否规范，和它显示在页面的哪个位置关系倒是不大。

还有一种情况多少也值得留意，就是把较大篇幅的引用内容集中写进脚注里。有的作者以为脚注不计重，便把重复率偏高的段落挪到注释部分，这种做法其实存在一定风险。毕竟不是所有学校都采用剔除脚注的检测模式，全文比对时脚注里的照搬内容同样可能被标出来。而且评审环节对注释部分往往也看得比较仔细，大段直接转录的文献原文，容易被认为引用不够规范，问题未必体现在查重报告上，但说不定会在评阅阶段带来一些负面影响。

比较稳妥的做法，大致可以归纳为这样几点。脚注尽量统一用文档自带的插入功能生成，引用信息按学校要求的格式著录完整。不太确定学校是否剔除脚注的时候，可以翻一翻查重通知里关于全文检测或正文检测的说明，或者干脆直接问一下教务部门，问一句的事，总比自己来回猜要可靠。定稿阶段还是以学校指定系统的检测结果为准，其他平台的结果只能作个参考，毕竟各家系统的口径往往存在差异，越比照反而越容易焦虑。