论文查重时参考文献列表被标红，确实挺让人头疼，毕竟这部分内容通常是引用别人的研究成果，按理说不应该算重复。不过，查重系统有时候会把参考文献也当成正文来比对，但是若格式不规范或者引用方式有问题，就容易被误判。

最常见的原因是参考文献的格式不符合查重系统的要求。不同的查重系统对参考文献的识别规则不一样，有的要求特定的引用格式，比如APA、MLA、IEEE等，如果格式不对，系统可能无法识别这是引用，就会把它当成普通文字来比对，结果标红。所以，第一步要检查参考文献的格式是否规范，包括作者、年份、标题、期刊名、卷号、页码等信息是否完整，标点符号是否正确。

参考文献的排列顺序也可能导致问题。有些系统会按照字母顺序或引用顺序排列参考文献，如果你的参考文献顺序混乱，或者和正文中的引用顺序不一致，系统可能会认为这是重复内容。

另外，如果参考文献中有一些通用的、被广泛引用的文献，比如经典的理论著作或重要论文，这些内容可能在数据库的文献中出现频率很高，系统就容易把它们标红。

解决办法主要有几个：一是严格按照学校或期刊要求的格式来调整参考文献，确保每个条目都符合规范；二是检查正文中的引用标记是否和参考文献列表一一对应，避免出现漏引或错引；三是如果某些参考文献确实被误标，可以在查重报告中标记为引用，或向学校说明情况。