论文参考文献部分是否计入论文查重检测，这个问题不能一句话说死，得看你检测的口径和学校提交的版本，总体上可以分几种情况来说。

先说结论性的判断，大多数检测系统对规范格式的参考文献是能够识别并剔除的。像知网、维普、万方这些主流查重系统，都有针对参考文献的识别机制，如果你论文最后的参考文献列表是按规范格式写的，条目齐全，格式标准，系统一般会自动识别这是参考文献部分，然后把这部分的文字从重复率计算里剔除，也就是说这部分内容虽然提交上去了，但不会算进重复率的分子，通常也不会算进分母，属于检测时被排除的灰色区域。

但这里的前提是格式规范，系统靠格式特征来识别参考文献，比如条目以编号开头，作者、题名、出处、年份这些字段排列规整，如果格式乱七八糟，有的条目有年份有的没有，标点符号五花八门，系统就可能识别不出来，把参考文献当成正文来检测，而参考文献里全是别人论文的标题、期刊名、作者名，这些内容和库里数据几乎必然重复，一旦被当正文算，重复率立刻被拉高一大截，每年都有人纳闷自己正文没多少标红，重复率却高得离谱，追查下来往往是参考文献格式不规范没被识别剔除。

再说说实际操作里的坑。第一个坑是正文中引用标注的写法，正文里的上标编号系统一般能识别，但如果你在正文里大段写出文献的完整题目，比如在文献综述里直接把某篇论文的标题原封不动写进去，这部分内容系统不会因为你后面挂了个引用编号就放过，该标红还是标红，所以综述里转述文献观点时要用自己话概括，别整段照搬文献原文加个引号就想蒙混过关。

第二个坑是英文文献，部分系统对英文参考文献的识别能力弱一些，英文条目没被剔除的概率比中文条目高，如果你的英文文献很多，检测前最好了解清楚学校用的系统对英文部分的口径。第三个坑是提交版本的问题，有些学校送检时要求去掉参考文献再提交，有些则要求全文提交由系统自动处理，你要按学校的提交要求来，别自作主张删掉参考文献，删了可能影响格式审查，也别多此一举地担心系统算它，规范格式下系统自然会处理。