论文查重时脚注与参考文献不对应，它会不会直接导致标红，得分情况来看，但无论是否标红，这都是一个严重的学术规范问题，绝对不能掉以轻心。

我们先说最直接的情况，就是脚注和参考文献列表里都出现了同样的错误信息。比如，你在脚注里引用了一本书，但作者名字写错了，或者出版年份写错了，而你在文末的参考文献列表里，也原封不动地抄录了这个错误的信息。

在这种情况下，查重系统在进行比对时，如果它恰好也收录了另一篇同样犯了这种错误的论文，那么你这段错误的脚注内容和错误的参考文献条目，都可能会因为与那篇论文的“巧合”而被标红。当然，这种概率相对较低，但它提醒我们，错误本身也是一种信息，同样可能被查重系统捕捉到。

更常见也更需要警惕的是另一种情况，就是脚注和参考文献的不对应，本身并不会直接因为“不对应”这个行为而被标红，但它会引发一系列连锁反应，最终导致大面积的标红。你在正文中用脚注引用了一个观点，比如标注为①，然后你在文末的参考文献列表里，却没有列出编号①对应的文献，或者列错了。这时候，查重系统会怎么处理呢？它会先看你的正文内容，发现你这句话的观点和数据库里的某篇文献高度相似，于是它就把这句话标红了。然后它去看你的脚注，发现脚注①里写的信息，比如“张三，《论文学》，2020年”，这个信息在数据库里找不到完全匹配的条目，或者它根本就不去管脚注。接着它去看你的参考文献列表，发现里面根本没有编号①，或者编号①对应的是另一本完全不相关的书。

这样一来，查重系统就得出一个结论：你在正文里使用了一段与他人高度相似的文字，但你没有提供任何有效、规范的引用信息来佐证它的来源。在系统看来，这和直接抄袭几乎没有区别，所以这段文字不仅会被标红，而且会被判定为高风险的重复内容。