论文查重系统本身并不是一个固定不变的东西，它会受到很多因素的影响。比如说，你今天查了一遍，过几天再查一次，可能结果就会有点不一样，这并不是系统出了问题，而是它的工作原理和数据库在动态变化。

论文查重的核心是比对，把你写的内容和数据库里已有的文献、期刊、网络资源、其他人的论文进行对比。这些数据库并不是一成不变的，尤其是像知网、万方这些主流平台，每天都有新的内容被加进去，你第一次查的时候可能某些内容还没被收录，第二次查的时候可能就多了一些新的比对源，这样重复率自然就会有些波动。而且不同的查重系统，算法也不完全一样，有的系统对引用格式识别得更严格，有的对网络资源的抓取更全面，这些都会导致结果不一致。

还有一个因素就是你自己的论文。如果你在两次查重之间对内容做了修改，哪怕只是调整了段落顺序、换了一些表达方式，也可能影响查重结果。因为查重系统并不只是看单个句子是否重复，它还会分析段落结构、语义相似度，甚至有时候会忽略一些格式上的小变化。所以你改得越多，结果就越可能不一样。

查重系统的设置也很关键。有些系统可以设置是否排除参考文献、是否忽略引用部分，这些选项不同，查出来的重复率也会差不少。如果你第一次查的时候没排除引用，第二次查的时候排除了，那结果肯定不一样。所以如果你想尽量保持结果一致，最好每次查重的时候都用同一个系统，同一个版本，设置也保持一致。

论文查重不同批次的结果很难做到完全一样，因为数据库在更新，系统算法有差异，论文内容可能也在变。但如果你能控制好这些变量，比如用同一个系统、同一个版本，设置不变，中间别大幅度改论文，那结果应该会比较接近。