论文查重是个复杂的过程，涉及到识别文本相似度的同时，也要判断哪些部分是合理引用。在学术界，正确引用他人研究成果不仅被允许，而且是必要的，因为它展示了作者对现有研究的了解以及自己工作的立足点。不过，这个界限有时候挺模糊的，因为不同的人可能有不同的看法。

当一篇论文提交到查重系统中时，系统首先会扫描全文，找出与数据库中已有文献相匹配的文字片段。这时候，系统并不知道这些重复的部分是抄袭还是合理引用。它只是单纯地指出哪些地方看起来很像其他已发表的作品。真正区分这两者的任务往往落在了人身上，特别是那些负责审核论文的编辑或导师们。

对于人类审阅者来说，要判断一处引用是否合理，得看几个方面。首先是引用的目的，如果引用是为了支持自己的观点、提供证据或者对比不同的理论，这样的引用通常被认为是合理的。其次，格式也很重要，正确的引用方式需要按照特定的学术规范来写，比如APA、MLA等格式，包括引文应该放在引号内，并且在参考文献列表里有相应的条目。这样做的好处是既给了原作者应有的认可，也避免了被视为剽窃的风险。

当然论文查重系统也在不断进步，试图更好地理解和处理引用的情况。一些先进的查重工具能够识别出常见的引用格式，并自动将其排除在相似度计算之外。这意味着如果你按照标准格式引用资料，这些引用部分就不会增加你的总重复率。不过，这也要求作者必须准确无误地使用引用格式，任何小错误都可能导致系统无法正确识别引用，从而影响最终结果。