论文查重的时候，脚注格式没按照学校规范来它到底会不会被标红，情况其实有点复杂，不能一概而论。咱们得先明白查重系统的工作原理，它本质上是个文本比对工具，它的主要任务是把你论文里连续的、可识别的文字，拿去跟它的庞大数据库进行匹配。所以，问题的关键就在于，你那个不规范的脚注，在系统看来，到底算不算一段可以被正常识别和比对的“正文”。

如果你的不规范，只是指字体、字号或者标点符号跟学校要求的模板有出入，比如要求用宋体五号你用了楷体小四，或者要求用圈码①你用了方括号[1]，但脚注里的文字内容本身是“作者，《书名》，出版社，年份，第几页”这样清晰可辨的，那查重系统大概率会把它当成普通文本来处理。这时候，如果脚注里引用的那句话或者那段描述，碰巧跟数据库里的某篇文献重复了，那它照样会被标红。反过来，如果你的脚注内容是你自己写的原创性解释，那就算格式不对，它也不会因为重复而被标红，因为它根本就没有重复的对象。所以，在这种情况下，格式错误本身不直接导致标红，但它会间接影响你的重复率计算。

还有另一种更糟糕的情况，就是你的格式不规范到了一个程度，导致查重系统根本不认为那是个脚注。比如，你本该用自动插入的脚注功能，结果嫌麻烦，直接在页面底端手动打了一段文字，并且没有用任何上标符号在正文里做标记。这样一来，查重系统就会把页面底端那段话，完完整整地当作你论文正文的一部分来扫描。如果那段话恰好是引用了某本书的核心观点，而且字数还不少，那恭喜你，你的重复率可能会瞬间飙升一大截，而且查重报告里会显示出一大段触目惊心的红色，你自己看了都心慌。

更麻烦的是有些学校用的查重系统比较智能，它会识别一些特定的引用格式。如果你用的是标准的、规范的脚注格式，系统可能会在比对时自动忽略掉这些引用信息，只比对正文内容。可你一旦格式乱了，系统识别不出来，它就可能把原本应该被忽略的引用信息也算进重复率里，这就非常冤枉了。所以，脚注格式不规范，它带来的风险不仅仅是可能被标红，更重要的是它会扰乱查重系统的正常判断逻辑，让你的查重结果变得不准确，充满了不确定性。