毕业论文查重用不同版本去检测，结果肯定是会变的，论文查重系统用的数据库是不断更新的，今天查的时候可能某些文献还没收录进去，过段时间再查，这些新文献就被加进来了，那结果自然就不一样了。还有就是你提交的论文版本本身，要是你改了几个字，调整了段落顺序，或者删掉了一些引用，这些改动都可能影响查重结果，哪怕只是微小的变化。

不同的查重系统或者同一个系统的不同设置也会导致结果不一样。比如有些学校用的是知网，有些用万方，还有些用维普，这些系统的数据库和算法都不完全相同，查出来的重复率肯定会有差异。就算是同一个系统，你选择的比对范围不一样，比如只比对期刊论文还是包括学位论文、会议论文等等，结果也会不一样。甚至你提交的时间点不同，系统要是刚更新了数据库，结果也可能前后不一致。

还有一个容易被忽略的因素就是引用格式。你引用文献的时候，要是格式不规范，比如该加引号没加，或者参考文献列表里的信息和正文引用对不上，这些都会影响查重系统对重复内容的判断。有时候明明是正确引用，但因为格式问题被系统误判为抄袭，这种情况下你调整一下格式再查，结果可能就变了。所以说论文查重这事儿真不是一锤子买卖，每次查都可能有点小出入。

虽然不同版本的结果可能会有变化，但通常不会差得太离谱。要是你的论文原创性高，引用规范，那不管什么时候查、用什么系统查，结果应该都差不多。反过来要是内容里大段大段地抄别人的，那不管怎么改版本，查重率肯定都高。所以关键还是在于论文本身的质量和引用的规范性。