本研究旨在探究在进行毕业论文提交前的查重过程中，为何同一篇文章在不同时间或使用不同查重软件时，其重复率会出现差异的现象。通过详细分析查重系统的工作原理，比较市场上主流查重软件的算法和数据库的异同，以及实证分析在不同条件下的查重结果，本文揭示了影响查重结果差异的关键因素，并针对性地提出了优化方案与建议，不仅对提高查重系统的效能和公平性具有实际应用价值，同时也为广大学生和学术工作者在撰写和提交论文过程中，更有效地避免高重复率带来的不必要困扰提供了可操作的指南。

研究首先从查重技术的原理出发，详细介绍了文本相似度的检测方法和判定标准，进一步分析了不同查重软件在文献数据库更新、算法差异、以及文本处理能力上的差别，从技术角度解释了查重结果差异的根本原因。接着，通过实施对比实验，收集并分析了相同论文在不同查重软件与不同检测时间点上的查重报告，确立了查重结果差异的普遍性和规律性，验证了初步的假设。

此外，本文还在深度分析了查重系统的局限性基础上，讨论了当前查重系统对学术不端行为的识别能力和处理效果，指出了在实际操作中存在的一些问题，如对于文献引用和同义替换的处理不足等，并在此基础上提出了针对性的改进措施。例如，增强查重软件的数据库更新频率，优化算法以提高对于特定学科知识点和专业术语的识别能力，以及提升对文献引用正确性的评估精度等。

最后，研究指出，通过对查重系统的持续优化和完善，结合对学生和学者在论文写作和查重操作中的系统培训，可以有效降低学术不端行为的发生，提高学术论文的质量和原创性。同时，本研究强调了合理利用查重软件，并结合人工审查的重要性，以确保查重结果的准确性和公正性。

本研究不仅为理解和解决论文查重过程中遇到的重复率差异问题提供了科学依据和解决方案，也为查重软件的开发者提供了改进的方向，有助于促进学术诚信建设，保障学术环境的健康发展。